Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rad23bP54728 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rad23bP54728 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Rad23bP54728 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms