Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cacnb3P54285 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cacnb3P54285 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms