Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Map3k1P53349 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Map3k1P53349 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Map3k1P53349 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Map3k1P53349 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Map3k1P53349 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Map3k1P53349 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Map3k1P53349 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Map3k1P53349 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Map3k1P53349 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Map3k1P53349 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Map3k1P53349 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Map3k1P53349 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Map3k1P53349 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Map3k1P53349 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Map3k1P53349 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Map3k1P53349 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
Map3k1P53349 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Map3k1P53349 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Map3k1P53349 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Map3k1P53349 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Map3k1P53349 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Map3k1P53349 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Map3k1P53349 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
Map3k1P53349 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Map3k1P53349 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Map3k1P53349 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Map3k1P53349 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Map3k1P53349 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Map3k1P53349 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Map3k1P53349 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Map3k1P53349 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Map3k1P53349 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Map3k1P53349 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Map3k1P53349 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Map3k1P53349 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Map3k1P53349 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Map3k1P53349 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Map3k1P53349 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Map3k1P53349 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Map3k1P53349 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Map3k1P53349 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
Map3k1P53349 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Map3k1P53349 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms