Protein–RNA interactions for Protein: P52963

Epb41l4a, Band 4.1-like protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 686 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4aP52963 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Epb41l4aP52963 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Epb41l4aP52963 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Epb41l4aP52963 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Epb41l4aP52963 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epb41l4aP52963 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epb41l4aP52963 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epb41l4aP52963 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epb41l4aP52963 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epb41l4aP52963 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epb41l4aP52963 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epb41l4aP52963 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epb41l4aP52963 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epb41l4aP52963 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Epb41l4aP52963 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Epb41l4aP52963 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Epb41l4aP52963 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epb41l4aP52963 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Epb41l4aP52963 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms