Protein–RNA interactions for Protein: P51910

Apod, Apolipoprotein D, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApodP51910 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ApodP51910 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ApodP51910 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ApodP51910 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ApodP51910 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ApodP51910 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ApodP51910 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ApodP51910 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ApodP51910 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ApodP51910 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ApodP51910 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ApodP51910 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ApodP51910 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ApodP51910 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ApodP51910 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ApodP51910 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ApodP51910 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ApodP51910 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ApodP51910 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ApodP51910 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ApodP51910 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ApodP51910 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ApodP51910 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ApodP51910 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ApodP51910 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ApodP51910 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ApodP51910 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ApodP51910 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ApodP51910 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ApodP51910 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ApodP51910 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ApodP51910 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ApodP51910 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ApodP51910 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ApodP51910 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ApodP51910 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ApodP51910 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ApodP51910 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ApodP51910 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ApodP51910 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ApodP51910 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ApodP51910 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ApodP51910 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ApodP51910 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ApodP51910 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ApodP51910 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ApodP51910 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ApodP51910 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ApodP51910 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ApodP51910 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ApodP51910 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ApodP51910 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ApodP51910 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ApodP51910 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ApodP51910 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ApodP51910 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ApodP51910 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ApodP51910 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ApodP51910 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ApodP51910 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ApodP51910 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ApodP51910 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ApodP51910 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ApodP51910 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ApodP51910 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ApodP51910 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ApodP51910 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ApodP51910 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ApodP51910 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ApodP51910 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ApodP51910 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ApodP51910 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApodP51910 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApodP51910 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApodP51910 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApodP51910 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApodP51910 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApodP51910 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApodP51910 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApodP51910 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApodP51910 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApodP51910 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ApodP51910 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ApodP51910 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApodP51910 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApodP51910 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApodP51910 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApodP51910 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApodP51910 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApodP51910 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ApodP51910 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApodP51910 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApodP51910 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApodP51910 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApodP51910 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ApodP51910 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApodP51910 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApodP51910 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ApodP51910 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ApodP51910 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.4 ms