Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccr5P51682 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccr5P51682 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccr5P51682 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms