Protein–RNA interactions for Protein: P50580

Pa2g4, Proliferation-associated protein 2G4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pa2g4P50580 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pa2g4P50580 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pa2g4P50580 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pa2g4P50580 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pa2g4P50580 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pa2g4P50580 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pa2g4P50580 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pa2g4P50580 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pa2g4P50580 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pa2g4P50580 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pa2g4P50580 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pa2g4P50580 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pa2g4P50580 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pa2g4P50580 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pa2g4P50580 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pa2g4P50580 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pa2g4P50580 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pa2g4P50580 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pa2g4P50580 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pa2g4P50580 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pa2g4P50580 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pa2g4P50580 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pa2g4P50580 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms