Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SftpdP50404 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SftpdP50404 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SftpdP50404 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SftpdP50404 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SftpdP50404 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SftpdP50404 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpdP50404 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpdP50404 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpdP50404 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpdP50404 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpdP50404 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms