Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CitP49025 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CitP49025 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CitP49025 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CitP49025 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CitP49025 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CitP49025 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CitP49025 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CitP49025 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CitP49025 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CitP49025 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CitP49025 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CitP49025 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CitP49025 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CitP49025 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CitP49025 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CitP49025 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CitP49025 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CitP49025 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CitP49025 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CitP49025 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CitP49025 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CitP49025 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CitP49025 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CitP49025 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CitP49025 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CitP49025 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CitP49025 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CitP49025 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CitP49025 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CitP49025 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CitP49025 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CitP49025 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CitP49025 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CitP49025 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CitP49025 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CitP49025 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CitP49025 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CitP49025 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CitP49025 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CitP49025 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CitP49025 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CitP49025 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CitP49025 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CitP49025 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CitP49025 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CitP49025 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CitP49025 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CitP49025 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CitP49025 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CitP49025 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CitP49025 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CitP49025 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CitP49025 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CitP49025 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CitP49025 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CitP49025 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CitP49025 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CitP49025 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CitP49025 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CitP49025 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CitP49025 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CitP49025 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CitP49025 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CitP49025 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CitP49025 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CitP49025 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CitP49025 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CitP49025 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CitP49025 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CitP49025 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CitP49025 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CitP49025 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CitP49025 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CitP49025 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CitP49025 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CitP49025 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CitP49025 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CitP49025 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CitP49025 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CitP49025 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CitP49025 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CitP49025 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CitP49025 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CitP49025 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CitP49025 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CitP49025 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CitP49025 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CitP49025 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CitP49025 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CitP49025 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CitP49025 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CitP49025 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CitP49025 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CitP49025 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CitP49025 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CitP49025 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CitP49025 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CitP49025 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CitP49025 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms