Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brca1P48754 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brca1P48754 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brca1P48754 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brca1P48754 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Brca1P48754 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Brca1P48754 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brca1P48754 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Brca1P48754 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Brca1P48754 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Brca1P48754 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brca1P48754 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Brca1P48754 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brca1P48754 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms