Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rfx1P48377 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rfx1P48377 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rfx1P48377 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms