Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gbx2P48031 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gbx2P48031 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms