Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax9P47242 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax9P47242 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax9P47242 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax9P47242 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax9P47242 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax9P47242 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pax9P47242 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax9P47242 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax9P47242 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Pax9P47242 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms