Protein–RNA interactions for Protein: P47226

Tes, Testin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TesP47226 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TesP47226 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TesP47226 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TesP47226 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TesP47226 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TesP47226 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TesP47226 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TesP47226 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TesP47226 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TesP47226 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TesP47226 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TesP47226 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TesP47226 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TesP47226 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TesP47226 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TesP47226 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
TesP47226 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
TesP47226 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TesP47226 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TesP47226 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TesP47226 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TesP47226 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TesP47226 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TesP47226 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TesP47226 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TesP47226 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TesP47226 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TesP47226 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TesP47226 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TesP47226 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TesP47226 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TesP47226 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TesP47226 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TesP47226 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TesP47226 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TesP47226 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TesP47226 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TesP47226 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TesP47226 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TesP47226 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TesP47226 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TesP47226 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TesP47226 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TesP47226 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TesP47226 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TesP47226 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TesP47226 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TesP47226 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TesP47226 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TesP47226 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TesP47226 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TesP47226 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TesP47226 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TesP47226 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TesP47226 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TesP47226 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TesP47226 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TesP47226 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TesP47226 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TesP47226 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TesP47226 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TesP47226 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TesP47226 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TesP47226 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TesP47226 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TesP47226 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TesP47226 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TesP47226 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TesP47226 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TesP47226 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TesP47226 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TesP47226 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TesP47226 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TesP47226 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TesP47226 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TesP47226 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TesP47226 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TesP47226 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TesP47226 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TesP47226 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TesP47226 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TesP47226 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TesP47226 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TesP47226 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TesP47226 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TesP47226 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TesP47226 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TesP47226 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TesP47226 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TesP47226 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TesP47226 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TesP47226 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TesP47226 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TesP47226 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TesP47226 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TesP47226 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TesP47226 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TesP47226 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TesP47226 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TesP47226 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms