Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms