Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PtgfrP43117 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PtgfrP43117 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PtgfrP43117 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms