Protein–RNA interactions for Protein: P42208

Sept2, Septin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept2P42208 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sept2P42208 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sept2P42208 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sept2P42208 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sept2P42208 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sept2P42208 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sept2P42208 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sept2P42208 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sept2P42208 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sept2P42208 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sept2P42208 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sept2P42208 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sept2P42208 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sept2P42208 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sept2P42208 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sept2P42208 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sept2P42208 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sept2P42208 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sept2P42208 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sept2P42208 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Sept2P42208 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sept2P42208 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sept2P42208 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sept2P42208 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sept2P42208 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sept2P42208 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sept2P42208 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms