Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mmp9P41245 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Mmp9P41245 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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