Protein–RNA interactions for Protein: P41209

Cetn1, Centrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cetn1P41209 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cetn1P41209 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cetn1P41209 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cetn1P41209 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cetn1P41209 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cetn1P41209 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cetn1P41209 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cetn1P41209 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cetn1P41209 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cetn1P41209 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cetn1P41209 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cetn1P41209 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cetn1P41209 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cetn1P41209 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cetn1P41209 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cetn1P41209 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cetn1P41209 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cetn1P41209 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cetn1P41209 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cetn1P41209 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cetn1P41209 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cetn1P41209 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cetn1P41209 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cetn1P41209 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cetn1P41209 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cetn1P41209 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cetn1P41209 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cetn1P41209 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cetn1P41209 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cetn1P41209 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cetn1P41209 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cetn1P41209 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cetn1P41209 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cetn1P41209 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cetn1P41209 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cetn1P41209 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cetn1P41209 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cetn1P41209 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cetn1P41209 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cetn1P41209 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cetn1P41209 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cetn1P41209 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cetn1P41209 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cetn1P41209 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cetn1P41209 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cetn1P41209 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cetn1P41209 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cetn1P41209 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cetn1P41209 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cetn1P41209 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cetn1P41209 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cetn1P41209 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cetn1P41209 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cetn1P41209 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cetn1P41209 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cetn1P41209 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cetn1P41209 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cetn1P41209 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cetn1P41209 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cetn1P41209 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cetn1P41209 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cetn1P41209 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cetn1P41209 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cetn1P41209 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cetn1P41209 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Cetn1P41209 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms