Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syt4P40749 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syt4P40749 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Syt4P40749 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Syt4P40749 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syt4P40749 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syt4P40749 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Syt4P40749 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms