Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Csf3rP40223 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Csf3rP40223 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms