Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lig1P37913 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lig1P37913 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lig1P37913 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lig1P37913 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Lig1P37913 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lig1P37913 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lig1P37913 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lig1P37913 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lig1P37913 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lig1P37913 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lig1P37913 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig1P37913 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lig1P37913 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lig1P37913 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lig1P37913 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms