Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Stfa1P35175 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Stfa1P35175 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms