Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Stfa3P35173 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Stfa3P35173 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms