Protein–RNA interactions for Protein: P34968

Htr2c, 5-hydroxytryptamine receptor 2C, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr2cP34968 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Htr2cP34968 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Htr2cP34968 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms