Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Apoc1P34928 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Apoc1P34928 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.9 ms