Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nedd1P33215 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Nedd1P33215 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Nedd1P33215 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms