Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdh15P33146 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdh15P33146 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms