Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gsx2P31316 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gsx2P31316 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gsx2P31316 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gsx2P31316 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gsx2P31316 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gsx2P31316 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gsx2P31316 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gsx2P31316 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Gsx2P31316 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gsx2P31316 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gsx2P31316 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gsx2P31316 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms