Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxa11P31311 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxa11P31311 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxa11P31311 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms