Protein–RNA interactions for Protein: P30658

Cbx2, Chromobox protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx2P30658 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cbx2P30658 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cbx2P30658 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cbx2P30658 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms