Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VtnP29788 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VtnP29788 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VtnP29788 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VtnP29788 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VtnP29788 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VtnP29788 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VtnP29788 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VtnP29788 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VtnP29788 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VtnP29788 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VtnP29788 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VtnP29788 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VtnP29788 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VtnP29788 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VtnP29788 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VtnP29788 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VtnP29788 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VtnP29788 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VtnP29788 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VtnP29788 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VtnP29788 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VtnP29788 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VtnP29788 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VtnP29788 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VtnP29788 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VtnP29788 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VtnP29788 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VtnP29788 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VtnP29788 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VtnP29788 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VtnP29788 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VtnP29788 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VtnP29788 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VtnP29788 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VtnP29788 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VtnP29788 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VtnP29788 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VtnP29788 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VtnP29788 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VtnP29788 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VtnP29788 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VtnP29788 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VtnP29788 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VtnP29788 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VtnP29788 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VtnP29788 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VtnP29788 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VtnP29788 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VtnP29788 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VtnP29788 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VtnP29788 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VtnP29788 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VtnP29788 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VtnP29788 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VtnP29788 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VtnP29788 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VtnP29788 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VtnP29788 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VtnP29788 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VtnP29788 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VtnP29788 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VtnP29788 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VtnP29788 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VtnP29788 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VtnP29788 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VtnP29788 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VtnP29788 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VtnP29788 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VtnP29788 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VtnP29788 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VtnP29788 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VtnP29788 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VtnP29788 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VtnP29788 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VtnP29788 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VtnP29788 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VtnP29788 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VtnP29788 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VtnP29788 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VtnP29788 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VtnP29788 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VtnP29788 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VtnP29788 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VtnP29788 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VtnP29788 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VtnP29788 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VtnP29788 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VtnP29788 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VtnP29788 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VtnP29788 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VtnP29788 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VtnP29788 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VtnP29788 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VtnP29788 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VtnP29788 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VtnP29788 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VtnP29788 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VtnP29788 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VtnP29788 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms