Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PtprmP28828 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprmP28828 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PtprmP28828 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PtprmP28828 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PtprmP28828 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PtprmP28828 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PtprmP28828 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PtprmP28828 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprmP28828 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprmP28828 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PtprmP28828 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
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