Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RxraP28700 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RxraP28700 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RxraP28700 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RxraP28700 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RxraP28700 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RxraP28700 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RxraP28700 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RxraP28700 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RxraP28700 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RxraP28700 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RxraP28700 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RxraP28700 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RxraP28700 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RxraP28700 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RxraP28700 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RxraP28700 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RxraP28700 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RxraP28700 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RxraP28700 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RxraP28700 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RxraP28700 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RxraP28700 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RxraP28700 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RxraP28700 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RxraP28700 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RxraP28700 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RxraP28700 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RxraP28700 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RxraP28700 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RxraP28700 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RxraP28700 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RxraP28700 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RxraP28700 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RxraP28700 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RxraP28700 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RxraP28700 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RxraP28700 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RxraP28700 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RxraP28700 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RxraP28700 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RxraP28700 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RxraP28700 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RxraP28700 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RxraP28700 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RxraP28700 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RxraP28700 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RxraP28700 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RxraP28700 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RxraP28700 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RxraP28700 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RxraP28700 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RxraP28700 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RxraP28700 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RxraP28700 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RxraP28700 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RxraP28700 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RxraP28700 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RxraP28700 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RxraP28700 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RxraP28700 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RxraP28700 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RxraP28700 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RxraP28700 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RxraP28700 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RxraP28700 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RxraP28700 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RxraP28700 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RxraP28700 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RxraP28700 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RxraP28700 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RxraP28700 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RxraP28700 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RxraP28700 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RxraP28700 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RxraP28700 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RxraP28700 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RxraP28700 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RxraP28700 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RxraP28700 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RxraP28700 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RxraP28700 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RxraP28700 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RxraP28700 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RxraP28700 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RxraP28700 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RxraP28700 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RxraP28700 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RxraP28700 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RxraP28700 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RxraP28700 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RxraP28700 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RxraP28700 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RxraP28700 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RxraP28700 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RxraP28700 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RxraP28700 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RxraP28700 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RxraP28700 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RxraP28700 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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