Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NapbP28663 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NapbP28663 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NapbP28663 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NapbP28663 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NapbP28663 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NapbP28663 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NapbP28663 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NapbP28663 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NapbP28663 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NapbP28663 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NapbP28663 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NapbP28663 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NapbP28663 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NapbP28663 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NapbP28663 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NapbP28663 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NapbP28663 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NapbP28663 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NapbP28663 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NapbP28663 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NapbP28663 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NapbP28663 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NapbP28663 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NapbP28663 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NapbP28663 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NapbP28663 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NapbP28663 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NapbP28663 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NapbP28663 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NapbP28663 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NapbP28663 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NapbP28663 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NapbP28663 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NapbP28663 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NapbP28663 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NapbP28663 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NapbP28663 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NapbP28663 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NapbP28663 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NapbP28663 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NapbP28663 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NapbP28663 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NapbP28663 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NapbP28663 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NapbP28663 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NapbP28663 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NapbP28663 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NapbP28663 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NapbP28663 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NapbP28663 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NapbP28663 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NapbP28663 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NapbP28663 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NapbP28663 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NapbP28663 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NapbP28663 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NapbP28663 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NapbP28663 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NapbP28663 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NapbP28663 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NapbP28663 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NapbP28663 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NapbP28663 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NapbP28663 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NapbP28663 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NapbP28663 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NapbP28663 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NapbP28663 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NapbP28663 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NapbP28663 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NapbP28663 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NapbP28663 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NapbP28663 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NapbP28663 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NapbP28663 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NapbP28663 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NapbP28663 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NapbP28663 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NapbP28663 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NapbP28663 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NapbP28663 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NapbP28663 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NapbP28663 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NapbP28663 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NapbP28663 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NapbP28663 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NapbP28663 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NapbP28663 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NapbP28663 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NapbP28663 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NapbP28663 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NapbP28663 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NapbP28663 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NapbP28663 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NapbP28663 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NapbP28663 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NapbP28663 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NapbP28663 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NapbP28663 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms