Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dusp1P28563 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dusp1P28563 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms