Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Col2a1P28481 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col2a1P28481 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col2a1P28481 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms