Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxd10P28359 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Hoxd10P28359 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hoxd10P28359 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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