Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Hoxd9P28357 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxd9P28357 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms