Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gjc1P28229 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Gjc1P28229 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gjc1P28229 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gjc1P28229 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gjc1P28229 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjc1P28229 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gjc1P28229 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjc1P28229 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjc1P28229 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjc1P28229 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjc1P28229 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gjc1P28229 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjc1P28229 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjc1P28229 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Gjc1P28229 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjc1P28229 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjc1P28229 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjc1P28229 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gjc1P28229 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjc1P28229 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjc1P28229 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjc1P28229 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjc1P28229 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjc1P28229 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Gjc1P28229 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Gjc1P28229 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjc1P28229 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjc1P28229 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjc1P28229 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gjc1P28229 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gjc1P28229 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjc1P28229 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjc1P28229 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjc1P28229 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjc1P28229 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gjc1P28229 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjc1P28229 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjc1P28229 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gjc1P28229 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjc1P28229 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjc1P28229 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjc1P28229 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjc1P28229 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gjc1P28229 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Gjc1P28229 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gjc1P28229 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gjc1P28229 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjc1P28229 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gjc1P28229 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gjc1P28229 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gjc1P28229 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gjc1P28229 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjc1P28229 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjc1P28229 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gjc1P28229 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gjc1P28229 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjc1P28229 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjc1P28229 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gjc1P28229 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjc1P28229 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gjc1P28229 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gjc1P28229 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms