Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PdgfraP26618 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PdgfraP26618 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms