Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Itgb7P26011 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Itgb7P26011 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itgb7P26011 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms