Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hoxd12P23812 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd12P23812 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd12P23812 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms