Protein–RNA interactions for Protein: P23607

Zfa, Zinc finger autosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZfaP23607 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ZfaP23607 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZfaP23607 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZfaP23607 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZfaP23607 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZfaP23607 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZfaP23607 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZfaP23607 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZfaP23607 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZfaP23607 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZfaP23607 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms