Protein–RNA interactions for Protein: P23198

Cbx3, Chromobox protein homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3P23198 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cbx3P23198 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx3P23198 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx3P23198 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms