Protein–RNA interactions for Protein: P22339

Gadd45b, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45bP22339 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gadd45bP22339 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gadd45bP22339 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gadd45bP22339 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms