Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pou3f1P21952 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pou3f1P21952 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou3f1P21952 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou3f1P21952 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou3f1P21952 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou3f1P21952 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou3f1P21952 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou3f1P21952 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou3f1P21952 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou3f1P21952 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou3f1P21952 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou3f1P21952 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pou3f1P21952 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms