Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lmnb2P21619 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lmnb2P21619 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms