Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klra1P20937 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klra1P20937 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klra1P20937 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klra1P20937 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klra1P20937 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klra1P20937 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klra1P20937 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klra1P20937 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klra1P20937 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Klra1P20937 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klra1P20937 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klra1P20937 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klra1P20937 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klra1P20937 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Klra1P20937 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klra1P20937 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Klra1P20937 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms