Protein–RNA interactions for Protein: P20826

Kitlg, Kit ligand, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KitlgP20826 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KitlgP20826 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KitlgP20826 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KitlgP20826 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KitlgP20826 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KitlgP20826 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KitlgP20826 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KitlgP20826 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KitlgP20826 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KitlgP20826 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KitlgP20826 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KitlgP20826 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KitlgP20826 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KitlgP20826 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KitlgP20826 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms