Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ms4a2P20490 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ms4a2P20490 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ms4a2P20490 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms